A Interpretação da Gnose oferece uma oportunidade única de ver como um mestre gnóstico usa os escritos do Novo Testamento e os aplica à igreja. Características de estilo e estrutura sugerem que o texto apresenta uma homilia destinada a ser apresentada em um culto de adoração. A estrutura da discussão segue um padrão comum de adoração, no qual as leituras do evangelho são seguidas por leituras do apóstolo (ou seja, de Paulo). Da mesma forma, uma seção inicial de A Interpretação da Gnose (9,21-14,15) usa passagens conhecidas de Mateus para interpretar o ensino do Salvador e sua paixão; a seção seguinte (14,15-21,34) usa textos de 1 Coríntios e provavelmente Romanos, Colossenses, Efésios e Filipenses para interpretar a igreja como o corpo de Cristo. O autor está preocupado em abordar uma comunidade que está dividida por ciúmes e ódio sobre a questão dos dons espirituais. Alguns membros se recusam a compartilhar seus dons espirituais uns com os outros; outros invejam aqueles que receberam dons como profecia e falar em público e assim se destacam na congregação. Alguns desprezam outros que consideram ignorantes (ou seja, sem gnose); os demais se sentem menosprezados e ressentidos. A preocupação do autor em A Interpretação da Gnose é corrigir essa situação de divisão. Tendo relembrado como o Salvador ensinou a unidade do Pai (9,28-29) e, além disso, como o grande Filho aceitou voluntariamente a humilhação por causa de seus irmãos menores (14,28-29), ele agora aplica as lições de unidade e humildade à igreja. Primeiro ele relembra como a igreja recebeu a redenção; o Salvador aboliu o antigo laço da dívida que escravizava os condenados em Adão (14,34-36; cf. Cl 2,14) e proclamou em seu lugar o édito do Pai (14,29-31), oferecendo o perdão dos pecados e a libertação da morte (14,36-38). De 13,20 a 21,35, o autor retoma a metáfora paulina do corpo e de seus membros (cf. Rm 12,4-8; 1Co 12,12-31) e a combina com as imagens de Cristo como a Cabeça do corpo, a igreja (cf. Cl 1,18; 2,19; Ef 4,15-16), a fim de lembrar aos membros que todos participam do mesmo corpo e da mesma Cabeça. Apesar da diversidade de dons (cf. 1 Co 12:4), cada membro participa da mesma graça (16,18-24; cf. Ro 12:6); o mesmo poder que inspira o orador permite que o ouvinte entenda o que ele diz (16,31-38). Aqueles que recebem dons menores não devem se queixar, mas se alegrar pelo fato de também participarem do corpo (18,28-38; 1Co 12:14-26). Aqueles que recebem dons maiores, como o conhecimento (gnosis; cf. 1 Co 12:8), não devem desprezar os outros como inferiores ou ignorantes (17,25-26). Pelo contrário, você é ignorante quando os odeia (17,27), pois aqueles que demonstram ódio e ciúme em relação aos outros demonstram por sua atitude que ainda se assemelham ao demiurgo ciumento e ignorante. Essas atitudes revelam sua ignorância de Deus (15,30-33), o verdadeiro Pai, e de seu Filho.
Ampliando a imagem de Paulo da igreja como um organismo espiritual, o autor retoma a metáfora da planta com raízes, ramos e frutos, as raízes têm uma conexão umas com as outras e seus frutos são indivisíveis (19,31-33). Assim como as raízes existem para o bem dos frutos e para o outro, vamos nos tornar como as raízes, já que somos iguais (19,36-37). O texto termina com avisos de perseguição (20,20-38) e com a exortação de vencer o pecado; aqueles que o vencerem receberão uma coroa de vitória, assim como nossa Cabeça foi glorificada pelo Pai (21,30-34).
O autor, que se identifica como membro da igreja, compartilha textos bíblicos e termos que nos são familiares da ortodoxia cristã primitiva, enquanto usa a teologia valentiniana para interpretá-los para seu público. Esse mestre imagina que a igreja à qual ele se dirige inclui tanto cristãos psíquicos quanto pneumáticos; ele pode ter dirigido essa homilia a ambos, ou especificamente ao pequeno círculo dos eleitos. Esse texto oferece uma fonte primária significativa para entender como alguns cristãos gnósticos e, especificamente, alguns cristãos valentinianos entendem a igreja à luz dos ensinamentos de Jesus e das cartas de Paulo.