As fontes declaradas do Panarion incluem
Clemente de Alexandria,
Ireneu,
Hipólito, Eusébio, o Livro dos Jubileus, as Viagens de Pedro, as Subidas de Tiago, um tratado clementino dirigido a “presbíteros e virgens”, um
Evangelho segundo os Hebreus, o Livro de Elkasai e as Constituições Apostólicas; as duas mais importantes são o Syntagma perdido de
Hipólito — reconstruível a partir do Panarion, do Diversarum Haereseon Liber de Filástrio de Bréscia e do Pseudo-
Tertuliano — e o Contra Omnes Haereses de
Ireneu, citado amplamente e em extenso.