Moisés é o coração do simbolismo filônico — o mistério supremo que coroa o itinerário —, sendo o tipo do homem perfeito no qual não há progresso, mas plenitude originária.
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Goodenough identificou corretamente Moisés como o grande herói e hierofante dos mistérios filônicos.
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Em De Confusione Linguarum, 106, o berço onde Moisés é depositado é o corpo como a arca coberta de betume que envolve a alma: “A mente chamada Moisés, essa planta excelente, chamada de excelente em seu próprio nascimento… chora amargamente nos dias em que está aprisionada na arca do corpo manchada com 'asfalto-piche'… Chora por seu cativeiro, oprimida pelo anseio por uma natureza que não conhece o corpo.”
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O conflito de Moisés com o egípcio é o conflito da verdadeira filosofia com o epicurismo; a fuga para o deserto é o recolhimento na solidão.
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Moisés liberta as sete filhas de Jetro — os cinco sentidos, a fala e o instinto sexual — dos maus pastores;
Gregório de Nissa, seguindo Fílon, comenta (Patrologia Graeca XLIV, col. 332 B): “Depois de haver expulsado os pastores, isto é, tendo convencido os mestres da iniquidade do mau uso que fazem da educação, levaremos a vida solitária, todos os movimentos de nossa alma sendo guiados como um rebanho pelo Lógos.”
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O casamento de Moisés com Séfora é o grande mistério da união do espírito com a sabedoria (De Posteritate, 78); Séfora, como Rebeca, concebe pela ação de Deus (De Cherubim, 47).
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Em De Cherubim, 48–49, lê-se: “Esses pensamentos, ó iniciados de ouvidos purificados, recebei em vossas almas como sagrados mistérios e não os murmurareis a nenhum dos profanos… Eu mesmo fui iniciado sob Moisés, mas quando vi o profeta Jeremias e soube que ele não era apenas iluminado, mas digno ministro dos sagrados segredos, não tardei em tornar-me seu discípulo.” O sentido desse mistério é que “Deus é uma casa, a morada incorpórea de ideias incorpóreas, que é o pai de todas as coisas, pois as gerou, e o Esposo da Sabedoria.”
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A Páscoa significa a purificação da alma (De Specialibus Legibus II, 147): “Para os que costumam transformar fatos literais em alegoria, a festa da Travessia sugere a purificação da alma. Dizem que o amante da sabedoria está ocupado unicamente em cruzar para longe do corpo e das paixões, cada um dos quais o domina como uma torrente, a menos que a corrente impetuosa seja represada e contida pelos princípios da virtude.”
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O cavaleiro e o cavalo lançados ao mar são as quatro paixões e o nous culpado (Legum Allegoriae II, 102); as doze fontes de Elim são os pequenos mistérios relativos ao mundo; as setenta palmeiras são figuras dos grandes mistérios e das virtudes perfeitas (De Fuga, 187).
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O maná e a rocha de água viva são figuras do Lógos — o que antecipa estranhamente o Evangelho (Legum Allegoriae II, 86; II, 163).
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A ascensão ao Sinai é o cume da iniciação; em De Posteritate, 14, lê-se: “Vede-o [Moisés] entrar na densa escuridão onde Deus estava (Êxodo 20:21), isto é, em concepções relativas ao Ser Existente que pertencem à região inacessível onde não há formas materiais.”